Il Laboratorio Diffuso è una rete coordinata di spazi e competenze scientifiche distribuite sul territorio regionale, integrata operativamente con la Biobanca e sostenuta da centri di ricerca di alto profilo.
Le tre Università partner del progetto originario oggi ancora socie della società che gestisce la Biobanca – mettono a disposizione spazi, strumentazioni e know how per svolgere analisi di genomica, trascrittomica, proteomica e metabolomica, in bulk e in single cell.
Il laboratorio diffuso si articola sulle seguenti strutture:
- Università Politecnica delle Marche – Laboratorio di Single Cell Analysis
- Università di Camerino – Laboratorio di Immunoistochimica e Biologia Molecolare
- Università degli Studi di Urbino, Laboratorio di Metabolomica
Il personale tecnico dei laboratori supporta:
- progettazione e ottimizzazione di protocolli
- esecuzione di prove, misure ed esperimenti
- caratterizzazione dei campioni biologici (inclusi quelli conservati presso la Biobanca)
- consulenza su flussi di lavoro e interpretazione preliminare dei dati
Sono previste condizioni agevolate per la caratterizzazione dei campioni già conservati in Biobanca.
ACCESSO
AL LABORATORIO
Previo accordo con il responsabile del laboratorio diffuso di riferimento, possono richiedere l’accesso ai servizi:
- strutture e gruppi di ricerca dei soci di Marche Biobank Scarl e della ATS che ha gestito il progetto “Marche Biobank”;
- strutture di altre Università ed enti pubblici di ricerca;
- enti e soggetti privati (ricerca industriale, startup, spin-off, CRO, laboratori accreditati).
QuantStudio Absolute Q Digital PCR System
by Applied Biosystems
dPCR per quantificazione DNA e RNA.
Multiplexing.
Titoli virali, espressione genica, presenza di DNA residuale.
Detection di mutazioni e di basse frazioni alleliche, anche in campioni complessi.
Microdissettore laser LEICA LMD6
by Leica
Isolamento di Regioni di Interesse (ROI) da aree intere di tessuto, fino alle singole cellule, da biopsia solida.
Fase preliminare ad analisi single-cell.
FACSMelody Cell Sorter
by BD Biosciences
Cell sorting da biopsia liquida, propedeutico a single-cell multiomics analysis: arricchimento delle popolazioni cellulari per studi di espressione genica o amplificazione delle linee cellulari di interesse.
Citofluorimetro FACS Symphony A1
by BD Biosciences
Caratterizzazione immunofenotipica e funzionale di popolazioni cellulari.
Analisi fino a 14 marcatori, contemporaneamente.
NextSeq 1000 Sequencing Systems
by Illumina
Analisi mediante Next Generation Sequencing (Total RNA; mRNA; pannello NGS multigenico specifico).
4150 TapeStation System Agilent
by Agilent Technologies
Controllo qualità di RNA e DNA nell’ambito NGS, biobanking, sviluppo vaccini.
Chromium Xo
by 10X Genomics
Separazione automatica di single cell in GEM (Gel Beads in emulsione) e barcoding di mRNA per la costruzione di librerie finalizzate a studi di espressione genica.
A disposizione anche un termociclatore per l’amplificazione di cDNA.
SeqStudioTM Genetic Analyzer
by Applied Biosystems
Sequenziamento del DNA
Analisi di frammenti di DNA, per studi di polimorfismo genetico o per autenticazione cellulare.
Precellys Evolution Homogenizer
by Bertin Technologies
Omogeneizzatore rotativo, per preparare qualsiasi tipo di campione biologico.
Dotato di sistema refrigerante Cryolys Evolution
Facscope B Automatic Cell Counter
by Curiosis
Contacellule automatico stand-alone per misurare la conta e la vitalità cellulare.
Distributore di paraffina per sistemi di inclusione TEC 2000
by Histo-Line Laboratories
Erogatore di paraffina controllato da microprocessore per la conservazione di tessuto FFPE
Microscopio con fotocamera DS-Ri2
by Leica
Acquisizione rapida e a singola inquadratura di immagini a colori ad altissima risoluzione.
Vanquish Flex UHPLC Systems + Orbitrap Exploris 240
Analisi di metabolomica, di tipo targeted e untargeted.
U3000 Nano RSLC - Nano Sys for Easy-Spray + Orbitrap Exploris 240
Analisi di proteomica, di tipo targeted e untargeted.
Analisi di proteomica tramite approcci bottom-up e top-down e analisi di Modifiche Post-Traduzionali (PTM)